C'est la panique en Californie. Depuis peu, la population vit dans la terreur. En effet, deux incroyables créatures s'affrontent sans relâche. Au cours des combats, les dégâts s'avèrent inestimables. Rien ne semble pouvoir faire obstacle à leur puissance. L'US Navy entreprend alors de stopper ces monstres sous-marins. Mais le plan mis en oeuvre s'avère moins efficace que prévu. La colère de Méga Shark, dirigée jusqu'à présent vers Octopus, se détourne vers les humains. La dévastation devient le lot des habitants de Californie. Mais une Américaine, prénommée Emma, refuse de voir sa vie entière bouleversée par ces prédateurs apparemment indestructibles...