L'attaque des Wraith fait rage sur Atlantis. Le docteur Beckett est surpris de voir à quel point le lieutenant Ford se remet rapidement de ses blessures. Il soupçonne les Wraith de lui avoir injecté une substance qui pourrait se révéler destructrice. Alors que le major Sheppard et son équipe sont en mauvaise posture, le Dédale, un vaisseau très performant venu de la Terre, leur porte secours. Mais leur répit est de courte durée. Les Wraith préparent en effet une nouvelle attaque, beaucoup plus importante que la précédente. Les chances de survie de l'équipe résident en un plan orchestré par McKay, qui s'avère très compliqué à réaliser... Alors qu'ils explorent une planète ravagée par une attaque Wraith, McKay et Laura Cadman sont enlevés par un Dart ennemi. Sheppard et son équipe ont à peine le temps d'abattre le vaisseau avant qu'il ne franchisse la Porte des étoiles. McKay et Cadman restent introuvables. Le docteur Zelenka affirme cependant que les appareils détectent deux formes de vie. Toutefois, seul l'un d'entre eux pourra être rematerialisé, l'énergie faisant défaut. McKay apparaît mais constate rapidement que l'esprit de Cadman a pris possession de son corps. Ils vont devoir trouver une solution car cette cohabitation pourrait leur être fatale. Par ailleurs, Sheppard décide d'intégrer Ronon Dex à l'équipe...