Sur l'île de Zafira, Jonah a fait enlever Tali pour contraindre Tony et Ziva à stopper leur action contre lui. Tandis que Jonah veut accéder à la salle des serveurs ultra-sécurisée de Raigning fire pour en prendre le contrôle avec le 9.4, Boris veut exploiter une faille dans le malware et l'utiliser comme un cheval de Troie. Tony et Ziva vont réapprendre à se faire confiance et découvrir qui sont leurs véritables alliés...