Réduit à la taille d'une fourmi, Arthur, 10 ans, a découvert le monde minuscule des Minimoys, dans le jardin de sa grand-mère, chez qui il passe toutes ses vacances. Arthur va tenter de sauver ce peuple, menacé par le grand méchant Maltazard. Dans cette nouvelle aventure qui commence pour lui, il peut compter sur ses fidèles amis, la Princesse Sélénia et son petit frère Betamèche. Tous ensemble, ils s'arment de courage pour affronter les épreuves qui les attendent. Catastrophe à la Souche ! Arak a disparu, et sa toile en lambeaux, ne protège plus le village contre une attaque aérienne séide !! Bétamèche a l'idée de fabriquer une fausse araignée-marionnette qu'il pilote de l'intérieur. La vue de ce subterfuge retient un peu les séides, mais l'illusion ne dure que peu de temps, et l'attaque est imminente. Nos héros ont très peu de temps pour faire revenir la véritable Arak !