Toutes les 30 secondes, une personne disparaît aux Etats-Unis. A New York, une section spéciale du FBI, dirigée par Jack Malone, un ancien soldat, dresse le portrait psychologique de ces disparus, et recoupe les témoignages de leurs proches pour déterminer si cette disparition est volontaire, accidentelle ou criminelle. A l'orée de cette première saison, l'équipe accueille un nouvel agent spécial, Martin Fitzgerald, qui vient compléter l'équipe formée par Jack Malone, Vivian, Samantha et Danny. Aux Etats-Unis, la diffusion de chaque épisode était accompagnée d'un avis de disparition réel.