Castle et Beckett enquêtent sur la mort d'un inconnu retrouvé défenestré. Le tueur, Thomas Gage, s'évade de sa cellule et le corps de la victime disparaît de la morgue. Castle et Beckett sont enlevés par la CIA et rencontrent l'agent Sophia Turner. Ils traquent Thomas Gage pour empêcher un acte grave contre les Etats-Unis. Ils découvrent un téléphone militaire et identifient le dernier numéro composé. Le docteur Nelson Blakely, censé être mort, est impliqué. Il est abattu avant de révéler la crise imminente. Castle et Beckett sont poussés dans l'East River...