Après leur évasion de Jurassic World, les dinosaures survivants vivent sans surveillance sur Isla Nublar. Quand une éruption volcanique menace de les exterminer, Owen et Claire sont chargés de mettre onze espèces hors de danger. Owen parvient à retrouver la trace de Blue, un raptor qui est tout de suite neutralisé. Le couple s'aperçoit rapidement qu'il a été manipulé par l'homme d'affaires qui a initié la mission de sauvetage. Celui-ci s'est aperçu que les raptors pouvaient suivre des ordres. Selon lui, un prédateur dressé vaudrait des millions. Owen et Claire vont tout tenter pour faire capoter ses plans...