Les parents de Walter et l'équipe Scorpion se rendent à l'hôpital, au chevet de Megan, dont l'état de santé s'est considérablement aggravé ces dernières heures. Alors qu'ils se trouvent dans l'enceinte de l'hôpital, ils sont immédiatement mis en quarantaine. Un champignon mortel menace en effet de contaminer tout le monde. Ils seront bloqués dans l'établissement jusqu'à ce qu'une solution soit trouvée. Lorsque l'unité en charge des maladies infectieuses se trompe et vaporise un mauvais fongicide, la vie de toute l'équipe est en danger...