Tandis qu'Owen Granger est entre la vie et la mort, Deeks, Sam et Callen ont été arrêtés par différentes agences gouvernementales qui les retiennent prisonniers. Loin de se décourager, Hetty décide de faire cavalier seul et se démène pour sauver son équipe. Alors qu'elle se rend à l'hôpital, au chevet de Granger, Hetty laisse Kensi seule aux commandes de l'agence. C'est alors que celle-ci est enlevée à son tour par la taupe qui sévit au sein du NCIS. Les soupçons des enquêteurs s'orientent rapidement vers la CIA, mais il convient d'agir efficacement pour retrouver Kensi au plus vite...