Sur l'île Sainte Marie à Madagascar, une équipe d'archéologues mène une exploration unique au monde suite à la découverte de l'épave d'un navire pirate et des traces de leur campement. Leur mission est de percer les mystères de ce bateau et de comprendre le mode de vie de ces forbans. Grâce à leurs travaux, le repaire secret des pirates et l'ensemble de ses aménagements refont enfin surface.