Au fil des enquêtes, Sam et Martin se sont rapprochés. Le début de la troisième saison voit une liaison se nouer entre eux, tandis que de son côté, Jack divorce de Maria partie à Chicago avec leurs deux filles. Il reprend donc son poste à la tête de la section, au détriment de Vivian qui lui avait succédé et qui perd sa promotion. Mais Vivian souffre d'un grave problème de santé, qu'elle tente de cacher à ses collègues.