Matty envoie Mac et Riley dans le désert du Nevada, où s'est écrasé un mystérieux objet volant non identifié. Ils doivent se rendre dans la zone 51 pour enquêter, en collaboration avec le docteur Isaac Herman. Sur place, tous trois sont pris en chasse par des mercenaires masqués venus récupérer l'objet. Parallèlement, Riley fait face à un dilemme : doit-elle confier à Mac les informations secrètes dont elle a connaissance au sujet de son père ?