Le Stargazer, un navire de recherche civil, recueille à son bord des naufragés, officiers de la Navy qui s'avèrent être des terroristes. Ces derniers prennent le contrôle du bâtiment. L'équipe du NCIS est appelée au secours et se rend en Atlantique Nord. Arrivés sur place en hélicoptère, Parker, Palmer, Torres et Knight sont contraints de se cacher pour échapper aux preneurs d'otages...