Réduit à la taille d'une fourmi, Arthur, 10 ans, a découvert le monde minuscule des Minimoys, dans le jardin de sa grand-mère, chez qui il passe toutes ses vacances. Arthur va tenter de sauver ce peuple, menacé par le grand méchant Maltazard. Dans cette nouvelle aventure qui commence pour lui, il peut compter sur ses fidèles amis, la Princesse Sélénia et son petit frère Betamèche. Tous ensemble, ils s'arment de courage pour affronter les épreuves qui les attendent. Maltazard enduit les mains d'Arthur d'une lotion malfaisante qui crée une barrière entre le pommeau de l'Epée et le coeur de l'Elu. L'Epée le privant de sa magie, Arthur est facile à capturer et se fait enfermer à Nécropolis...