Le magasin de jouets d'Edward Magorium a été fondé en 1770 et jouit d'une grande réputation auprès des enfants. En effet, nulle part ailleurs on ne peut trouver des jouets animés et un catalogue magique exauçant tous les désirs des jeunes clients. Molly, une timide jeune femme, était très heureuse de travailler dans cet endroit incroyable jusqu'à ce que monsieur Magorium, qui vient d'avoir 243 ans, décide de lui léguer son entreprise. A partir de ce moment, le magasin se révolte et les jouets font grève. Pendant que le nouveau comptable, Henry Weston, évalue la valeur du magasin, Molly va tenter de percer le secret de la magie qui anime les lieux...