Reese et Shaw tentent de rejoindre Finch, infiltré sur un site gouvernemental de haute sécurité pour accomplir une mission qui pourrait être fatale à Samaritain, mais aussi à la Machine et à lui-même. Il a en effet décidé de détruire Samaritain en lui inoculant le virus informatique le plus dangereux au monde. Parallèlement, il discute du bien et du mal avec la Machine, qui lui fait part de simulations sur ce qui serait arrivé à différentes personnes si elle n'avait jamais existé. Finch découvre ainsi que la Machine a fini par développer son propre instinct de conservation et qu'elle en a fait une priorité absolue...